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[ Paquet source : sga  ]

Paquet : sga (0.10.15-7build1) [universe]

Liens pour sga

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Ressources Ubuntu :

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Responsable :

Please consider filing a bug or asking a question via Launchpad before contacting the maintainer directly.

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Ressources externes :

Paquets similaires :

de novo genome assembler that uses string graphs

Autres paquets associés à sga

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances
  • dep: libbamtools2.5.2 (>= 2.5.2+dfsg)
    dynamic library for manipulating BAM (genome alignment) files
  • dep: libc6 (>= 2.34)
    GNU C Library: Shared libraries
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [non armhf, riscv64]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
    dep: libgcc-s1 (>= 4.4) [riscv64]
  • dep: libgomp1 (>= 6) [non arm64, ppc64el]
    GCC OpenMP (GOMP) support library
  • dep: libstdc++6 (>= 11) [non arm64, ppc64el]
    GNU Standard C++ Library v3
    dep: libstdc++6 (>= 5.2) [arm64, ppc64el]
  • dep: perl
    Larry Wall's Practical Extraction and Report Language
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-pysam
    interface for the SAM/BAM sequence alignment and mapping format (Python 3)
  • dep: python3-ruffus
    Python3 computation pipeline library widely used in bioinformatics
  • dep: samtools
    processing sequence alignments in SAM, BAM and CRAM formats
  • dep: zlib1g (>= 1:1.1.4)
    compression library - runtime
  • rec: abyss
    de novo, parallel, sequence assembler for short reads

Télécharger sga

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 640,5 ko1 662,0 ko [liste des fichiers]
arm64 71,4 ko253,0 ko [liste des fichiers]
armhf 645,4 ko1 277,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 76,9 ko317,0 ko [liste des fichiers]
riscv64 677,4 ko1 472,0 ko [liste des fichiers]