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[ Paquet source : parsnp  ]

Paquet : parsnp (2.1.3+dfsg-1) [universe]

Liens pour parsnp

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Paquets similaires :

rapid core genome multi-alignment

Autres paquets associés à parsnp

  • dépendances
  • recommandations
  • suggestions
  • enhances
  • dep: fasttree
    phylogenetic trees from alignments of nucleotide or protein sequences
  • dep: harvest-tools
    archiving and postprocessing for reference-compressed genomic multi-alignments
  • dep: libc6 (>= 2.38)
    GNU C Library: Shared libraries
  • dep: libgcc-s1 (>= 3.3.1) [non armhf, riscv64]
    GCC support library
    dep: libgcc-s1 (>= 3.4) [riscv64]
    dep: libgcc-s1 (>= 3.5) [armhf]
  • dep: libgomp1 (>= 6)
    GCC OpenMP (GOMP) support library
  • dep: libmuscle1 (>= 3.7+4565)
    multiple alignment library for protein sequences
  • dep: libstdc++6 (>= 14)
    GNU Standard C++ Library v3
  • dep: mummer
    Efficient sequence alignment of full genomes
  • dep: phipack
    PHI test and other tests of recombination
  • dep: python3
    interactive high-level object-oriented language (default python3 version)
  • dep: python3-biopython
    Python3 library for bioinformatics
  • dep: python3-numpy
    Python library for numerical computations (Python 3)
  • dep: python3-pyspoa
    Python bindings to spoa
  • dep: python3-tqdm
    fast, extensible progress bar for Python 3 and CLI tool
  • dep: raxml
    Randomized Axelerated Maximum Likelihood of phylogenetic trees
  • dep: time
    GNU time program for measuring CPU resource usage

Télécharger parsnp

Télécharger pour toutes les architectures proposées
Architecture Taille du paquet Espace occupé une fois installé Fichiers
amd64 202,8 ko1 907,0 ko [liste des fichiers]
arm64 199,3 ko1 883,0 ko [liste des fichiers]
armhf 204,1 ko1 882,0 ko [liste des fichiers]
ppc64el 223,3 ko1 947,0 ko [liste des fichiers]
riscv64 239,6 ko1 891,0 ko [liste des fichiers]
s390x 191,1 ko1 887,0 ko [liste des fichiers]